RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	GDH3	P39708	457 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	SEO1	P39709	593 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ELO3	P40319	345 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	JEM1	P40358	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	MAM33	P40513	266 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	PRM2	P40534	656 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	REG1	Q00816	1014 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	PNG1	Q02890	363 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	GCN5	Q03330	439 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	INP2	Q03824	705 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ASA1	Q06822	443 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	UPC2	Q12151	913 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	CLN1	P20437	546 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	AMD2	P22580	549 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	HES1	P35843	434 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	HPM1	P40481	377 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	OPT1	P40897	799 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	YFL054C	P43549	646 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	YJL132W	P47014	750 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	YTP1	P53584	459 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	GRX8	Q05926	109 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	NTG2	Q08214	380 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	APC5	Q08683	685 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	UBX3	Q12229	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTC5	YOR118W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SIN4	P32259	974 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PRO1	P32264	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YRO2	P38079	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BAP2	P38084	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YBR225W	P38321	900 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YHR182W	P38870	785 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MIG2	P53035	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MAL11	P53048	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	UGO1	Q03327	502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PRC1	P00729	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SPS1	P08458	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YAK1	P14680	807 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SNF5	P18480	905 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SEC15	P22224	910 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PHO3	P24031	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PEX5	P35056	612 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YKR051W	P36142	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MRP21	P38175	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YHL012W	P38709	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	FRT2	P39734	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YIL001W	P40560	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YJR154W	P47181	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NUP84	P52891	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TEL2	P53038	688 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	COG2	P53271	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MET14	Q02196	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	NUP100	Q02629	959 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	CRN1	Q06440	651 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
RTC5	YOR118W	YEH2	Q07950	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	SPE1	P08432	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	MAS1	P10507	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	YCR099C	P25657	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	BUD14	P27637	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	PEX6	P33760	1030 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTC5	YOR118W	TFC3	P34111	1160 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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