RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	MRPL9	P31334	269 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	PTH2	P34222	208 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	MUP3	P38734	546 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	HAT2	P39984	401 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	BFA1	P47113	574 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	YJR154W	P47181	346 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	COG1	P53079	417 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	BOL2	P53082	120 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	VAC7	P53950	1165 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	PIR1	Q03178	341 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	GOT1	Q03554	138 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	YMR206W	Q03695	313 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	YDR109C	Q04585	715 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	MCA1	Q08601	432 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	YLR046C	Q12253	270 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	FUS1	P11710	512 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	NMT1	P14743	455 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	SAN1	P22470	610 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	MIH1	P23748	554 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	PEX34	P25584	144 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	HES1	P35843	434 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	STB5	P38699	743 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	PIK1	P39104	1066 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	COA1	P40452	197 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	HPM1	P40481	377 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	MAM33	P40513	266 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	TED1	P40533	473 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	NUP84	P52891	726 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	MIG2	P53035	382 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	COG2	P53271	262 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	SPO71	Q03868	1245 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	BLS1	Q06071	122 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	RIF2	Q06208	395 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	ESA1	Q08649	445 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	SOG2	Q08817	791 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YCK1	YHR135C	DAL81	P21657	970 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GEX1	P25596	615 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RSC6	P25632	483 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CTF13	P35203	478 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GEX2	P36173	615 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	LDB7	P38210	180 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ARP1	P38696	384 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ALG8	P40351	577 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	JEM1	P40358	645 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SPP2	Q02521	185 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	BCP1	Q06338	283 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	MCP2	Q06567	569 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YEH2	Q07950	538 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ICT1	Q12385	394 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TRP3	P00937	484 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ABF1	P14164	731 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SIN4	P32259	974 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SFP1	P32432	683 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SWE1	P32944	819 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SKT5	P34226	696 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PHO11	P35842	467 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	PHO12	P38693	467 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	EFM1	P38732	585 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	QDR1	P40475	563 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	MDJ2	P42834	146 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	AIM14	P53109	570 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	IBD2	P53892	351 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YNL143C	P53908	130 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YNL034W	P53963	612 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YNL018C	P53976	612 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GAS3	Q03655	524 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SPO20	Q04359	397 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	CCH1	P50077	2039 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	HMG2	P12684	1045 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SIR1	P21691	654 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	EMC1	P25574	760 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	ZIP1	P31111	875 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	SWH1	P35845	1188 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YBL029W	P38201	376 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	TIS11	P47977	285 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	COS6	P53344	381 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YCK1	YHR135C	YTP1	P53584	459 aa		6.07	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms