RNA–Protein interactions for RNA: YHL036W

MUP3, Transcript of Low affinity methionine permease, yeast

Gene MUP3, Length 1,641 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MUP3	YHL036W	DBF4	P32325	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	MRE11	P32829	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PXA2	P34230	853 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	OCT1	P35999	772 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	APD1	P38281	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	FAR3	P46671	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SMC3	P47037	1230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	BOP3	P53958	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ASI1	P54074	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	MCH4	Q08268	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SPE2	P21182	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ELO2	P25358	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PRD1	P25375	712 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	STB6	P36085	766 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YJL068C	P40363	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SGF73	P53165	657 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PIG1	Q06216	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	OSW1	Q08692	278 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	FRE3	Q08905	711 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	APL4	Q12028	832 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ISN1	Q99312	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	CHD1	P32657	1468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	CLB2	P24869	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	GCS1	P35197	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	CMC1	P36064	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ARN1	P38731	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YJL107C	P42947	387 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	PTR3	P43606	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	TWF1	P53250	332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ATP23	P53722	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RMT2	Q03305	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	COQ9	Q05779	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	DNF1	P32660	1571 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	NUP1	P20676	1076 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	CLB3	P24870	427 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	BOS1	P25385	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ICS2	P38284	255 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	DBP8	P38719	431 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YML6	P51998	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YGR127W	P53275	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	GAL4	P04386	881 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	APN1	P22936	367 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	BLI1	P35727	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	VPS41	P38959	992 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RSM23	Q01163	450 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	FIN1	Q03898	291 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	APE1	P14904	514 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	BUD14	P27637	709 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	HXT14	P42833	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	IRC7	P43623	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	AIM32	Q04689	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	ISA2	Q12425	185 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	SEC39	Q12745	709 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MUP3	YHL036W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	ERG11	P10614	530 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	MBR1	P23493	339 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	YME1	P32795	747 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	SEC66	P33754	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	YKL100C	P34248	587 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	PEX5	P35056	612 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	MSR1	P38714	643 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	SSU1	P41930	458 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	PAN1	P32521	1480 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MUP3	YHL036W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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