RNA–Protein interactions for RNA: YFL036W

RPO41, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase, yeast

Gene RPO41, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO41	YFL036W	CTP1	P38152	299 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SEA4	P38164	1038 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PPE1	P38796	400 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	FMO1	P38866	432 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	HEM14	P40012	539 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SCS3	P53012	380 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MRM2	P53123	320 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	VHS1	Q03785	461 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ECM11	Q04110	302 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	HDA2	Q06629	674 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SAS5	Q99314	248 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	REV1	P12689	985 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SIN4	P32259	974 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TFA2	P36145	328 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RIM2	P38127	377 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TAH11	P47112	604 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YJR142W	P47173	342 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DIA3	P52290	468 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	NNF2	P53253	936 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PRM1	P53835	661 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TEP1	P53916	434 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YLL054C	Q12244	843 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	UBR2	Q07963	1872 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RAD10	P06838	210 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TOP3	P13099	656 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CBF1	P17106	351 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YCL068C	P25593	260 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TIP20	P33891	701 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PHO11	P35842	467 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PHO12	P38693	467 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YHL012W	P38709	493 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YJL206C	P39529	758 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SNG1	P46950	547 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MPS3	P47069	682 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	BOL2	P53082	120 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	BCP1	Q06338	283 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	NDL1	Q06568	189 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YET3	Q07451	203 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RHO2	P06781	192 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	APE1	P14904	514 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CLB4	P24871	460 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GPI10	P30777	616 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TFC1	P32367	649 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	LYP1	P32487	611 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MUM2	P38236	366 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DBP8	P38719	431 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	JEM1	P40358	645 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CTR1	P49573	406 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YNR061C	P53747	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YNL034W	P53963	612 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YNL018C	P53976	612 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ARP9	Q05123	467 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SWC7	Q06707	132 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AFI1	Q99222	893 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YLR422W	Q06409	1932 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MRP13	P12686	339 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DAL1	P32375	460 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YBR241C	P38142	488 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	LDB7	P38210	180 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YBR032W	P38223	100 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ACO2	P39533	789 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SEO1	P39709	593 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GIP2	P40036	548 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	OSW5	P40219	148 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PEP8	P40335	379 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YIR007W	P40566	764 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YFL054C	P43549	646 aa		2.59	□□□□□ -1.99

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