RNA–Protein interactions for RNA: YBR279W

PAF1, Transcript of Component of the Paf1p complex involved in transcription elongation, yeast

Gene PAF1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAF1	YBR279W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SNF3	P10870	884 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	RPN12	P32496	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SEF1	P34228	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	UBA4	P38820	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YIL152W	P40455	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	BET4	Q00618	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	RSM23	Q01163	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	EKI1	Q03764	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	MED1	Q12321	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	MRP7	P12687	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SNC1	P31109	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	MIC60	P36112	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	ALG5	P40350	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YIL169C	P40442	995 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	RTS2	P40962	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SAD1	P43589	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	DSD1	P53095	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	LCL3	P53153	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YGL082W	P53155	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SOL4	P53315	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	NGL3	Q03210	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SSK1	Q07084	712 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SDH5	Q08230	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	TAH18	Q12181	623 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	SPE4	Q12455	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAF1	YBR279W	CBS1	P14066	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	UBP11	P36026	717 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	LAG1	P38703	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	MET30	P39014	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	CIN4	P39110	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	COG4	Q06096	861 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ARP6	Q12509	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YPT6	Q99260	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	OCA4	P25366	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RAD24	P32641	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	NUP133	P36161	1157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ERG7	P38604	731 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
PAF1	YBR279W	MRX6	P48564	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	DUG3	P53871	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	FMP42	Q04991	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	GRS2	Q06817	618 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RTP1	Q12751	981 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
PAF1	YBR279W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	MGR1	P25573	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	BZZ1	P38822	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	CUL3	P53202	744 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YGR126W	P53274	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	VPS75	P53853	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	NUP100	Q02629	959 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YCR043C	P25361	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	PHD1	P36093	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YBR225W	P38321	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ERP2	P39704	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	IPI3	P53877	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	VPS38	Q05919	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	AVL9	Q12500	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	SYN8	P31377	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	TRS65	P32893	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ARP1	P38696	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	CCT6	P39079	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	ATG27	P46989	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	PKP2	P53170	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAF1	YBR279W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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