RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACAD9	Q9H845	621 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF543	Q08ER8	600 aa		19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKS1A	Q92625	1134 aa		19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TINF2	Q9BSI4	451 aa		19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF146	Q9NTX7	359 aa		19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PNMA2	Q9UL42	364 aa		19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	19.42	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		19.41	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYBA	P13498	195 aa		19.41	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	19.41	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		19.41	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		19.41	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMA4	Q16363	1823 aa		19.41	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035		E7EWF7	191 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ICAM1	P05362	532 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNHG28	P0DPA3	235 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	LHX8	Q68G74	356 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF536	O15090	1300 aa		19.4	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	POTEB2	H3BUK9	544 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEPT4	O43236	478 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRPV1	Q8NER1	839 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		19.39	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CENPF	P49454	3210 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PFAS	O15067	1338 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC45	O75419	566 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHA2	P01877	340 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	EVI5	O60447	810 aa		19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	WTAP	Q15007	396 aa		19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF20	Q5VTR2	975 aa		19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANO1	Q5XXA6	986 aa		19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	NSMF	Q6X4W1	530 aa		19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		19.36	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEC23A	Q15436	765 aa		19.36	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		19.36	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHST3	Q7LGC8	479 aa		19.36	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	RARB	P10826	455 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKR1A1	P14550	325 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	19.35	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASB14	A6NK59	587 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC27A2	O14975	620 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNTN2	Q02246	1040 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CPVL	Q9H3G5	476 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		19.34	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		19.33	■□□□□ 0.69
JMJD1C-211	ENST00000633035	KBTBD13	C9JR72	458 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNM1L	O00429	736 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCM5	P33992	734 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACVR2B	Q13705	512 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	NECTIN1	Q15223	517 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	USH1G	Q495M9	461 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARMCX2	Q7L311	632 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLRF2	D3W0D1	207 aa		19.32	■□□□□ 0.68

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