RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K11Q16584 847 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PGBD1Q96JS3 809 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKZQ13574 1117 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A14Q15043 492 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 STK38Q15208 465 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNG4Q8TDN1 519 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf42Q96LP6 360 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 CSADQ9Y600 493 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf81C9J6K1 198 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAP25P60880 206 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPAQ15257 358 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 BICD2Q8TD16 824 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 AMNQ9BXJ7 453 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM75PA6NK02 468 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTLC2O15270 562 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 VCAM1P19320 739 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO11Q86XK2 927 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KIFC2Q96AC6 838 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC10P48553 1259 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCY7P51828 1080 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP6R2O75170 966 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MOB2Q70IA6 237 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA7Q9UN72 937 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ME1P48163 572 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGCS2P54868 508 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAF1Q13077 416 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 LDHDQ86WU2 507 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL5Q93034 780 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT7AO00755 349 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP2B1P20020 1258 aa28.46■■■□□ 2.15
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CAPNS1-215ENST00000628018 TTC38Q5R3I4 469 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PPATQ06203 517 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ADALQ6DHV7 355 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ELP3Q9H9T3 547 aa28.45■■■□□ 2.15
CAPNS1-215ENST00000628018 PARP14Q460N5 1801 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAF5O00463 557 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 USH1GQ495M9 461 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ERO1BQ86YB8 467 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 JMYQ8N9B5 988 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM260Q9NX78 707 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRFP10586 1907 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC174Q6PII3 467 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQ27 194 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQ64 194 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQD8 194 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FLOT1O75955 427 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 INF2Q27J81 1249 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM63CQ9P1W3 806 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP15O95972 392 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.145e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF174Q15697 407 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2SQ16763 222 aa28.42■■■□□ 2.14
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