RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 SLX4Q8IY92 1834 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CAMTA2O94983 1202 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 C8AP07357 584 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ADH5P11766 374 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 RAB6AP20340 208 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 EHHADHQ08426 723 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D9BQ66K14 1250 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 SERPINB2P05120 415 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 NFICP08651 508 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 TEFQ10587 303 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 TMC7Q7Z402 723 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ASIC4Q96FT7 647 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.1□□□□□ -1.27
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HERC3-212ENST00000597259 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 MAPK1P28482 360 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 CFAP53Q96M91 514 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-212ENST00000597259 STARD3NLO95772 234 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 NFE2L2Q16236 605 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.08□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.08□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 ECEL1O95672 775 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.06□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 WDR90Q96KV7 1748 aa7.06□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 A0A096LPE4 126 aa7.05□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 A0A1W2PPZ6 126 aa7.05□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.05□□□□□ -1.28
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HERC3-212ENST00000597259 POU4F3Q15319 338 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 KRT24Q2M2I5 525 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 PROSER3Q2NL68 480 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 CCDC184Q52MB2 194 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-212ENST00000597259 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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