RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TNFRSF25Q93038 417 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PNKPQ96T60 521 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PHACTR2O75167 634 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TFAP4Q01664 338 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 SGSM3Q96HU1 749 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 STX8Q9UNK0 236 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TAF1P21675 1872 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PPP2R5AQ15172 486 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 INF2Q27J81 1249 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.99□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TXLNAP40222 546 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PBX1P40424 430 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 RPAINQ86UA6 219 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 NID2Q14112 1375 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CTAGE9A4FU28 777 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 LRRC31Q6UY01 552 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 RABGGTAQ92696 567 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 SRGAP2O75044 1071 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 KLK7P49862 253 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CNGA4Q8IV77 575 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 HPS3Q969F9 1004 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 KAT14Q9H8E8 782 aa11.98□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CDC23Q9UJX2 597 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 IRF6O14896 467 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 USP5P45974 858 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 UBE4AQ14139 1066 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 BLIDQ8IZY5 108 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 KAT2BQ92831 832 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 UIMC1Q96RL1 719 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.97□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TTC26A0AVF1 554 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ZMYND10O75800 440 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CALM1P0DP23 149 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CALM2P0DP24 149 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CALM3P0DP25 149 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 VPS72Q15906 364 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PNMA1Q8ND90 353 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM47Q96LD4 638 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ABCB6Q9NP58 842 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 CHD4Q14839 1912 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 MAP2K7O14733 419 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 DDAH1O94760 285 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 GRIK5Q16478 980 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.96□□□□□ -0.49
FCHO1-216ENST00000596536 B4DLN1 442 aa11.96□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SCP2P22307 547 aa11.96□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 UBA7P41226 1012 aa11.96□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 RCAN1P53805 252 aa11.96□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 VSNL1P62760 191 aa11.96□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms