RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NEDD1Q8NHV4 660 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GLT1D1Q96MS3 346 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 HOMER2Q9NSB8 354 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH4Q9Y623 1939 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM265A0A087WTH1 108 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMP1P01033 207 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ASGR1P07306 291 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP3P12645 472 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 FOSL2P15408 326 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 KATNBL1Q9H079 304 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ELP1O95163 1332 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPY3P0CV98 308 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPY8P0CW00 308 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK7P50613 346 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GJA9P57773 515 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTN2Q02246 1040 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH7Q68CQ1 1323 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM232C9JQI7 657 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE5O15320 804 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TFAP4Q01664 338 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP4CQ96CF2 233 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.474e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-211ENST00000590874 SPC25Q9HBM1 224 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB2P25686 324 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT2P52630 851 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE4BQ07343 736 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PPARAQ07869 468 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD5Q6N075 450 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM133AQ8N9E0 248 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAD9Q9H845 621 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF536O15090 1300 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIN2CQ14957 1233 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GNASQ5JWF2 1037 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 VTI1AQ96AJ9 217 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 AGBL1Q96MI9 1066 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NAPBQ9H115 298 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ARVCFO00192 962 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FDX1P10109 184 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GMCL1Q96IK5 515 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FSD1Q9BTV5 496 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF146Q9NTX7 359 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 VCANP13611 3396 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SOWAHBA6NEL2 793 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 BEX3Q00994 111 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM160B2Q86V87 743 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 STAG1Q8WVM7 1258 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ASTN1O14525 1302 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXP2O15409 715 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MCCP23508 829 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC1A4P43007 532 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX3-2P78367 333 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 IKQ13123 557 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.472e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM3APO60318 1980 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ERC2O15083 957 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CSF2RAP15509 400 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM240Q5SV17 173 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CHURC1Q8WUH1 139 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGS1P23219 599 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAP25P60880 206 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP2Q03169 654 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD1Q719H9 257 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TIFAQ96CG3 184 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF576Q9H609 170 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 INCENPQ9NQS7 918 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.44■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 NMT2O60551 498 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ALAS1P13196 640 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RASIP1Q5U651 963 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC174Q6PII3 467 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17RBQ9NRM6 502 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 STX8Q9UNK0 236 aa30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa30.42■■■□□ 2.46
CAPNS1-211ENST00000590874 GRXCR1A8MXD5 290 aa30.42■■■□□ 2.46
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