RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.61■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.61■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.61■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 ESYT2A0FGR8 921 aa22.6■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.6■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 GNA11P29992 359 aa22.6■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.6■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PGBD1Q96JS3 809 aa22.6■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 YEATS4O95619 227 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 VCAM1P19320 739 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 ATP2B1P20020 1258 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 STK38Q15208 465 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 FAM160B2Q86V87 743 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 CSADQ9Y600 493 aa22.59■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 TRAF5O00463 557 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 HMGCS2P54868 508 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 SLC39A14Q15043 492 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PTPAQ15257 358 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 MAP3K11Q16584 847 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 AMNQ9BXJ7 453 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.58■■□□□ 1.21
PGS1-211ENST00000589425 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.58■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 C19orf81C9J6K1 198 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 WNT7AO00755 349 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 FBXO11Q86XK2 927 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 SPTLC2O15270 562 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 MBD3O95983 291 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 OTOFQ9HC10 1997 aa22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ADCY7P51828 1080 aa22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 C12orf42Q96LP6 360 aa22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ELP3Q9H9T3 547 aa22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.56■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 USH1GQ495M9 461 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 BICD2Q8TD16 824 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ME1P48163 572 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 TMEM260Q9NX78 707 aa22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 CCDC174Q6PII3 467 aa22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 LDHDQ86WU2 507 aa22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 FLOT1O75955 427 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 CUL5Q93034 780 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 TRAPPC10P48553 1259 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 UBE2SQ16763 222 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 INF2Q27J81 1249 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 TTC38Q5R3I4 469 aa22.53■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 PPP6R2O75170 966 aa22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 PPATQ06203 517 aa22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ZNF174Q15697 407 aa22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 ERO1BQ86YB8 467 aa22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PGS1-211ENST00000589425 IRF6O14896 467 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 ADALQ6DHV7 355 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 OTUD5Q96G74 571 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 USP17L15C9J2P7 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 USP17L11C9JVI0 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 USP17L18D6R9N7 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 USP17L22D6RA61 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PGS1-211ENST00000589425 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.51■■□□□ 1.19
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