RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPAQ15257 358 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM160B2Q86V87 743 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.85■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SNAP25P60880 206 aa29.84■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC39A14Q15043 492 aa29.84■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 RRAGCQ9HB90 399 aa29.84■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.84■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 VCAM1P19320 739 aa29.83■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 STK38Q15208 465 aa29.83■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K11Q16584 847 aa29.83■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa29.83■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNG4Q8TDN1 519 aa29.83■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.83■■■□□ 2.37
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM75PA6NK02 468 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 C12orf42Q96LP6 360 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 SPTLC2O15270 562 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 AMNQ9BXJ7 453 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29.82■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 BICD2Q8TD16 824 aa29.81■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 KIFC2Q96AC6 838 aa29.81■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 RIC8AQ9NPQ8 531 aa29.81■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CSADQ9Y600 493 aa29.81■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 C19orf81C9J6K1 198 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 WNT7AO00755 349 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 ADCY7P51828 1080 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 MOB2Q70IA6 237 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO11Q86XK2 927 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAPPC10P48553 1259 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA7Q9UN72 937 aa29.8■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PARP14Q460N5 1801 aa29.79■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGCS2P54868 508 aa29.79■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.79■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRFP10586 1907 aa29.78■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 ME1P48163 572 aa29.78■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.78■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP6R2O75170 966 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT25Q7Z3Z0 450 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 SLF1Q9BQI6 1058 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF8L1A6NGE4 600 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAF5O00463 557 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP2B1P20020 1258 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CUL5Q93034 780 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC38Q5R3I4 469 aa29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 LDHDQ86WU2 507 aa29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 PSTPIP2Q9H939 334 aa29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM63CQ9P1W3 806 aa29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 USH1GQ495M9 461 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 ADALQ6DHV7 355 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 ELP3Q9H9T3 547 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM260Q9NX78 707 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 RLFQ13129 1914 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 GLT8D2Q9H1C3 349 aa29.75■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.352e-6■■■□□ 17.6
SCAMP4-210ENST00000588555 INF2Q27J81 1249 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 ERO1BQ86YB8 467 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.74■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 OPLAHO14841 1288 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 FLOT1O75955 427 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 LIG1P18858 919 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 PPATQ06203 517 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAF1Q13077 416 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 UBE2SQ16763 222 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC174Q6PII3 467 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 JMYQ8N9B5 988 aa29.73■■■□□ 2.35
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PQ27 194 aa29.72■■■□□ 2.35
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