RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 AIFM3Q96NN9 605 aa14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 LCTP09848 1927 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CPLX1O14810 134 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 BCRP11274 1271 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 OSBPP22059 807 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 HOMER1Q86YM7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.59□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 OPLAHO14841 1288 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CA12O43570 354 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CDKL5O76039 1030 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ICAM1P05362 532 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 OAZ1P54368 228 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC174Q6PII3 467 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 C17orf99Q6UX52 265 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 MB21D1Q8N884 522 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 STXBP3O00186 592 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 TLR2O60603 784 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 FDX1P10109 184 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SCG2P13521 617 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 DDX11Q96FC9 970 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RNF186Q9NXI6 227 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RIPK3Q9Y572 518 aa14.57□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 HTTP42858 3142 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 DEXIO95424 95 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ALDH1A1P00352 501 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ERVK-9P63128 1117 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ERVK-24P63145 666 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 NPY5RQ15761 445 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 Q3C1V9 767 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CPA4Q9UI42 421 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PLXNB2O15031 1838 aa14.56□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ADAMTS3O15072 1205 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ZBED4O75132 1171 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CAP1Q01518 475 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 FBXO11Q86XK2 927 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CPXCR1Q8N123 301 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 AMNQ9BXJ7 453 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PORCNQ9H237 461 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 BARHL2Q9NY43 387 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 MGAMO43451 1857 aa14.55□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 NFIBO00712 420 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 GJB2P29033 226 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 CTGFP29279 349 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 STAT3P40763 770 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 SLC4A3P48751 1232 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 GHRHRQ02643 423 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 BECN1Q14457 450 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 USH1GQ495M9 461 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.54□□□□□ -0.08
DNMT1-208ENST00000586667 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms