RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 GNA11P29992 359 aa26.86■■□□□ 1.89
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RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.86■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.86■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 AMNQ9BXJ7 453 aa26.86■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 C6orf50Q9HD87 102 aa26.86■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.86■■□□□ 1.89
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RARA-AS1-201ENST00000581080 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.85■■□□□ 1.89
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ADAMTS3O15072 1205 aa26.84■■□□□ 1.89
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RARA-AS1-201ENST00000581080 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXO11Q86XK2 927 aa26.84■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP28Q96RU2 1077 aa26.84■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CXCL11O14625 94 aa26.84■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FLOT1O75955 427 aa26.84■■□□□ 1.89
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM87AQ8NBN3 555 aa26.84■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.84■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.83■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OPTNQ96CV9 577 aa26.83■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.83■■□□□ 1.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTMSP20962 102 aa26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NBR1Q14596 966 aa26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPRFP10586 1907 aa26.82■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAF1Q13077 416 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 BICD2Q8TD16 824 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADCY7P51828 1080 aa26.81■■□□□ 1.88
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RARA-AS1-201ENST00000581080 CST9Q5W186 159 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SPATA32Q96LK8 384 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.81■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USH1GQ495M9 461 aa26.8■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.8■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.8■■□□□ 1.88
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RARA-AS1-201ENST00000581080 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.79■■□□□ 1.88
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ELP1O95163 1332 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM205CA6NFA0 338 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L15C9J2P7 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L11C9JVI0 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L18D6R9N7 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L22D6RA61 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L19D6RCP7 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L20D6RJB6 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 FDX1P10109 184 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP17L24Q0WX57 530 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 COG2Q14746 738 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
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RARA-AS1-201ENST00000581080 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.79■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLIC4Q9Y696 253 aa26.79■■□□□ 1.88
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa26.77■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF536O15090 1300 aa26.77■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PARP14Q460N5 1801 aa26.77■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 VWA5AO00534 786 aa26.76■■□□□ 1.88
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RARA-AS1-201ENST00000581080 GJA5P36382 358 aa26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TREML2Q5T2D2 321 aa26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 YEATS4O95619 227 aa26.76■■□□□ 1.87
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAPPC10P48553 1259 aa26.76■■□□□ 1.87
RARA-AS1-201ENST00000581080 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.76■■□□□ 1.87
RARA-AS1-201ENST00000581080 RLFQ13129 1914 aa26.76■■□□□ 1.87
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