RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A1W2PQY0	241 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TIMP1	P01033	207 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	RARB	P10826	455 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAAP100	Q0VG06	881 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	EHD4	Q9H223	541 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MROH8	Q9H579	483 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	COBL	O75128	1261 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	BMP1	P13497	986 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TFCP2	Q12800	502 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6	1e-6	■■□□□ 11.9
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	COG2	Q14746	738 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB30	Q15771	203 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A0G2JMZ2	1700 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	JUND	P17535	347 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERCC3	P19447	782 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	MCAM	P43121	646 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM240	Q5SV17	173 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MTX1	Q13505	466 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ACER1	Q8TDN7	264 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	REV3L	O60673	3130 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	FCER1A	P12319	257 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	AKR1A1	P14550	325 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGFBP4	P22692	258 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ELP1	O95163	1332 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MYH1	P12882	1939 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERC2	O15083	957 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC25A27	O95847	323 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	PGK1	P00558	417 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ACLY	P53396	1101 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTPRN	Q16849	979 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRANK1	O15050	2925 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TOM1L1-223	ENST00000576932	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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