RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM60Q495X7 471 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 COX20Q5RI15 118 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 RASIP1Q5U651 963 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 USP6NLQ92738 828 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PICK1Q9NRD5 415 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 STIM2Q9P246 746 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 JAG2Q9Y219 1238 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.51□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 UTYO14607 1347 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PLXNA3P51805 1871 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 KIAA0355O15063 1070 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ITGB8P26012 769 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF76P36508 570 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 RGS2P41220 211 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 GDF10P55107 478 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 RAB15P59190 212 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 RAB30Q15771 203 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 WNT2BQ93097 391 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 APBA2Q99767 749 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 LNPKQ9C0E8 428 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CAPN10Q9HC96 672 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MAST3O60307 1309 aa6.5□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TRIOO75962 3097 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 KBTBD13C9JR72 458 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SNAP23O00161 211 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CHL1O00533 1208 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TAF5LO75529 589 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CSF1RP07333 972 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CLTBP09497 229 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ALADP13716 330 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 RAG1P15918 1043 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MAPK4P31152 587 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 EMP3P54852 163 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SH3BP2P78314 561 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 AAMPQ13685 434 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 KRT24Q2M2I5 525 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TREML2Q5T2D2 321 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CACNA1BQ00975 2339 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.49□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 FAM205CA6NFA0 338 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ZBTB39O15060 712 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 RGS20O76081 388 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ATP2B1P20020 1258 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ATP2B2Q01814 1243 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MAP3K10Q02779 954 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CCL14Q16627 93 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC174Q6PII3 467 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MSRAQ9UJ68 235 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.48□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD62A6NC57 917 aa6.47□□□□□ -1.37
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