RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571947.5

TRAPPC1-204, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC1, Length 306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-204ENST00000571947 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.01□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 LOC285556D6RIA3 1793 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 A0A1W2PRG0 241 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 USP17L10C9JJH3 530 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZBTB5O15062 677 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 BMP3P12645 472 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 SLC16A2P36021 539 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CAP2P40123 477 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ADCY7P51828 1080 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TNFAIP1Q13829 316 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 RASA3Q14644 834 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 STX1AQ16623 288 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ANO6Q4KMQ2 910 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 BTNL9Q6UXG8 535 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 KRBA2Q6ZNG9 492 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 C4orf32Q8N8J7 132 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 FAM200AQ8TCP9 573 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 COA7Q96BR5 231 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 PDLIM2Q96JY6 352 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TEPSINQ96N21 525 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CSRNP2Q9H175 543 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 RIC8AQ9NPQ8 531 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 GINM1Q9NU53 330 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ANO10Q9NW15 660 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 KIAA1468Q9P260 1216 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TMX2Q9Y320 296 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 H7C1D1 291 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 LAD1O00515 517 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 EGFRP00533 1210 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ASNSP08243 561 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 LMNB1P20700 586 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MCM7P33993 719 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 INF2Q27J81 1249 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 LONRF3Q496Y0 759 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 SPECC1Q5M775 1068 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 KANK3Q6NY19 840 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ACER1Q8TDN7 264 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 GLT8D2Q9H1C3 349 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 SH2D4AQ9H788 454 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CBX8Q9HC52 389 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 GOPCQ9HD26 462 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 USP25Q9UHP3 1055 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 HACL1Q9UJ83 578 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 LCTP09848 1927 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TMEM232C9JQI7 657 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 RAD21O60216 631 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 PLA2G6O60733 806 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 PRPHP41219 470 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ECE1P42892 770 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 ZNF165P49910 485 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 NLRP12P59046 1061 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 TRAF1Q13077 416 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 IQCB1Q15051 598 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 IL17AQ16552 155 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MCTP2Q6DN12 878 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 USP49Q70CQ1 688 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 NEK8Q86SG6 692 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 GPC2Q8N158 579 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CNNM3Q8NE01 707 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 CUL5Q93034 780 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 HOOK2Q96ED9 719 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRAPPC1-204ENST00000571947 AMNQ9BXJ7 453 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms