RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 RTL9Q8NET4 1388 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 I3L4J1 428 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PFDN6O15212 129 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 VPS41P49754 854 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 MTX1Q13505 466 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 CSRNP2Q9H175 543 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 GSTA4O15217 222 aa9.26□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 KCNA1Q09470 495 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 HIF1AQ16665 826 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 SNX19Q92543 992 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 IFNB1P01574 187 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 TMOD1P28289 359 aa9.26□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 PKP1Q13835 747 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PTK2BQ14289 1009 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 DCTPP1Q9H773 170 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 APOA4P06727 396 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 KCTD2Q14681 263 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 XKR9Q5GH70 373 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 HHATQ5VTY9 493 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.26□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 HOXC9P31274 260 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PRPSAP1Q14558 356 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 HVCN1Q96D96 273 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 VCX3BQ9H321 246 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 SNX25Q9H3E2 840 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 KRT82Q9NSB4 513 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 A0A087WWV3 80 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 KRT12Q99456 494 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 ELP1O95163 1332 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 UBXN8O00124 270 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 A1BGP04217 495 aa9.25□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 TNRQ92752 1358 aa9.25□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 PTPREP23469 700 aa9.24□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
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PDPR-210ENST00000568530 STMN1P16949 149 aa9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 KRT83P78385 493 aa9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 C2orf69Q8N8R5 385 aa9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 RAET1EQ8TD07 263 aa9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 USP19O94966 1318 aa9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 HLA-DPA1P20036 260 aa9.24□□□□□ -0.93
PDPR-210ENST00000568530 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.24□□□□□ -0.93
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