RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC174Q6PII3 467 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 PNMA1Q8ND90 353 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 TINF2Q9BSI4 451 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 KAT14Q9H8E8 782 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 TNKSO95271 1327 aa25.06■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 NEFLP07196 543 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 ACAD9Q9H845 621 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 RNF146Q9NTX7 359 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.05■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 ICAM1P05362 532 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 DPF3Q92784 378 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 LAMA4Q16363 1823 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 SEPT4O43236 478 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 ALAS1P13196 640 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.03■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 E7EWF7 191 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 SEC23AQ15436 765 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 NCOA7Q8NI08 942 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.01■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 FGD4Q96M96 766 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 PNMA2Q9UL42 364 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 POTEB2H3BUK9 544 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 COL6A1P12109 1028 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.99■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 PFASO15067 1338 aa24.98■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 H0YGN5 161 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 CNTN2Q02246 1040 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 ANO1Q5XXA6 986 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 CPVLQ9H3G5 476 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.97■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 CDC45O75419 566 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 NECTIN1Q15223 517 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RNPS1-218ENST00000566180 ERICH2A1L162 156 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 DNM1LO00429 736 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 SLC27A2O14975 620 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 EVI5O60447 810 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 CASC1Q6TDU7 716 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 NSMFQ6X4W1 530 aa24.95■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 NFIBO00712 420 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 AKR1A1P14550 325 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 ANTXR2P58335 489 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 ARMCX2Q7L311 632 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 CHST3Q7LGC8 479 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.94■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 RARBP10826 455 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 ACVR2BQ13705 512 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 WTAPQ15007 396 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 SENP2Q9HC62 589 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.93■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 ASB14A6NK59 587 aa24.92■■□□□ 1.58
RNPS1-218ENST00000566180 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms