RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 RHOVQ96L33 236 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 KLHL3Q9UH77 587 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 NUDT19A8MXV4 375 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 FKTNO75072 461 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF205O95201 554 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 PRAMEF1O95521 474 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 GBP1P32455 592 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 LIMS1P48059 325 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 SRGAP3O43295 1099 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 NOBOXO60393 691 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 BMP8BP34820 402 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 USP31Q70CQ4 1352 aa5.78□□□□□ -1.48
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 FERMT3Q86UX7 667 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 LNPKQ9C0E8 428 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 RNF38Q9H0F5 515 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.77□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 PF4P02776 101 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ATF2P15336 505 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CTSKP43235 329 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 FOXO4P98177 505 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 MPP2Q14168 576 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CPZQ66K79 652 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 NUP43Q8NFH3 380 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 JMJD8Q96S16 334 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SPATA25Q9BR10 227 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 RNF19AQ9NV58 838 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 USP40Q9NVE5 1235 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 PRR13Q9NZ81 148 aa5.76□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1B0GTL3 188 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 GRIN3BO60391 1043 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ATE1O95260 518 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CYBBP04839 570 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CCNFP41002 786 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 MVKQ03426 396 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 REC114Q7Z4M0 266 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SAMD11Q96NU1 681 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CHST7Q9NS84 486 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SRRDQ9UH36 339 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 OVOL3O00110 214 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 VAV1P15498 845 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 GIPC2Q8TF65 315 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 GMIPQ9P107 970 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 DBHP09172 617 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CTSHP09668 335 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 TCF3P15923 654 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ZNF20P17024 532 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 GARTP22102 1010 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 ARSHQ5FYA8 562 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 RTP2Q5QGT7 225 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CARFQ8N187 725 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 TMEM74Q96NL1 305 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 LRRC3Q9BY71 257 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 USP35Q9P2H5 1018 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 RAG1P15918 1043 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CNR2P34972 360 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CHMP4BP1P59074 171 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 C8orf37Q96NL8 207 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-202ENST00000558300 MLECQ14165 292 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 BCL11AQ9H165 835 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-202ENST00000558300 NCAM1P13591 858 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms