RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.98■■□□□ 1.91
CLMN-205ENST00000556416 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.98■■□□□ 1.91
CLMN-205ENST00000556416 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.915e-18■□□□□ 9.6
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CLMN-205ENST00000556416 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.97■■□□□ 1.91
CLMN-205ENST00000556416 BRAPQ7Z569 592 aa26.97■■□□□ 1.91
CLMN-205ENST00000556416 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.97■■□□□ 1.91
CLMN-205ENST00000556416 TREML2Q5T2D2 321 aa26.97■■□□□ 1.91
CLMN-205ENST00000556416 FBXO11Q86XK2 927 aa26.97■■□□□ 1.91
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CLMN-205ENST00000556416 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.96■■□□□ 1.91
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CLMN-205ENST00000556416 USP17L15C9J2P7 530 aa26.95■■□□□ 1.9
CLMN-205ENST00000556416 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.95■■□□□ 1.9
CLMN-205ENST00000556416 USP17L11C9JVI0 530 aa26.95■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.95■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 USP17L20D6RJB6 530 aa26.95■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 USH1GQ495M9 461 aa26.94■■□□□ 1.9
CLMN-205ENST00000556416 GALNT17Q6IS24 598 aa26.94■■□□□ 1.9
CLMN-205ENST00000556416 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.94■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 C6orf50Q9HD87 102 aa26.94■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 GNA11P29992 359 aa26.92■■□□□ 1.9
CLMN-205ENST00000556416 DSG3P32926 999 aa26.92■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 TNFRSF25Q93038 417 aa26.92■■□□□ 1.9
CLMN-205ENST00000556416 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.92■■□□□ 1.9
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CLMN-205ENST00000556416 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
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CLMN-205ENST00000556416 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.89■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.89■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 GTF2A2P52657 109 aa26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 CPXCR1Q8N123 301 aa26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.88■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 CETPP11597 493 aa26.87■■□□□ 1.89
CLMN-205ENST00000556416 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.87■■□□□ 1.89
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