RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556272.1

PCNX1-211, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 2

Gene PCNX1, Length 2,942 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-211ENST00000556272 ADORA1P30542 326 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 KIF18AQ8NI77 898 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 OGFRQ9NZT2 677 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 DISP2A7MBM2 1401 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 CUTAO60888 179 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 HIP1RO75146 1068 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PFKFB1P16118 471 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ETFBP38117 255 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 METTL24Q5JXM2 366 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 E2F7Q96AV8 911 aa8.37□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 A0A0G2JLW4 131 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 A0A1B0GVL5 298 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PDE8AO60658 829 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PDE8BO95263 885 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GNAT2P19087 354 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 MCAMP43121 646 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TRAPPC10P48553 1259 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 DMTNQ08495 405 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PPP2R5BQ15173 497 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 RESP18Q5W5W9 173 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 APOA5Q6Q788 366 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 NLRP10Q86W26 655 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 RTL9Q8NET4 1388 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 BCL9O00512 1426 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SLC26A4O43511 780 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ITGA6P23229 1130 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TRIM29Q14134 588 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 NCAPHQ15003 741 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PTPAQ15257 358 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 VPS37DQ86XT2 251 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 RNF135Q8IUD6 432 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 LPIN2Q92539 896 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ALG1Q9BT22 464 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 KRT23Q9C075 422 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 NBPF3Q9H094 633 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GPR182O15218 404 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 FGFR2P21802 821 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SYKP43405 635 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GUCY1B3Q02153 619 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 NR1H3Q13133 447 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SCARF1Q14162 830 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 CHST3Q7LGC8 479 aa8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 KIF28PB7ZC32 967 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ZBTB43O43298 467 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 MYL5Q02045 173 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 MCL1Q07820 350 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TOMM20Q15388 145 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 NTRK3Q16288 839 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 KRT40Q6A162 431 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 MAP3K14Q99558 947 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 DACH1Q9UI36 760 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 KIF3CO14782 793 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 IFNAR1P17181 557 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 HAND2P61296 217 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GPSM2P81274 684 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SQSTM1Q13501 440 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 Q3C1V9 767 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 PDE6AP16499 860 aa8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 ARMC3Q5W041 872 aa8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 OLFM4Q6UX06 510 aa8.34□□□□□ -1.07
PCNX1-211ENST00000556272 FAM89AQ96GI7 184 aa8.34□□□□□ -1.07
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