RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	DCX	O43602	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	CABYR	O75952	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	PFKM	P08237	780 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	PSMC6	P62333	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	ICA1	Q05084	483 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-208	ENST00000547298	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	CYP2C9	P11712	490 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ST18	O60284	1047 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	KCNA5	P22460	613 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	GNAI3	P08754	354 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SMPD1	P17405	629 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ACTN1	P12814	892 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ZP2	Q05996	745 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	GPNMB	Q14956	572 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	IER5L	Q5T953	404 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ZNF536	O15090	1300 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TNKS	O95271	1327 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	RFC2	P35250	354 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-208	ENST00000547298	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298		E9PSI1	815 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	CDK8	P49336	464 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ERVK-21	P61565	698 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	FOXK2	Q01167	660 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TCF15	Q12870	199 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	POLA2	Q14181	598 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-208	ENST00000547298	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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