RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNK12	Q9HB15	430 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	CD320	Q9NPF0	282 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL3	Q9UH77	587 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	PGR	P06401	933 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ETV3	P41162	512 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVFC1	P60507	584 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	AMPD3	Q01432	767 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE4B	Q07343	736 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	MLEC	Q14165	292 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC6A19	Q695T7	634 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	FEZ1	Q99689	392 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ADCY3	O60266	1144 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SUSD5	O60279	629 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	HPX	P02790	462 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	MASP1	P48740	699 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	HK2	P52789	917 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ANAPC15	P60006	121 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	NCAPH	Q15003	741 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNA10	Q16322	511 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM87B	Q96K49	555 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308		Q96M66	194 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ASMTL	O95671	621 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	GLDC	P23378	1020 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNHG1-222	ENST00000545308	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC7A5	Q01650	507 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM192	Q8IY95	271 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM13C	Q8NE31	585 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SP110	Q9HB58	689 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SRF	P11831	508 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	RAG1	P15918	1043 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	TCEA2	Q15560	299 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNN1	Q92952	543 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF32	Q9H0A6	362 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	ERCC6	Q03468	1493 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	PRRG2	O14669	202 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	MARCH6	O60337	910 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	UBOX5	O94941	541 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF2C	Q99661	725 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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