RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 TLE2Q04725 743 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CPXCR1Q8N123 301 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.12■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 TMEM232C9JQI7 657 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 SLC1A4P43007 532 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ACLYP53396 1101 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ACVR2BQ13705 512 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ACAD9Q9H845 621 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CDH23Q9H251 3354 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CLTBP09497 229 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 NT5C2P49902 561 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 GJA9P57773 515 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 FERMT2Q96AC1 680 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 LAMA4Q16363 1823 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 TSPY2A6NKD2 308 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ARMCX2Q7L311 632 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 SMC5Q8IY18 1101 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CDK7P50613 346 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 VPS53Q5VIR6 699 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 Q7L0L9 218 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 BADQ92934 168 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 STX8Q9UNK0 236 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBR-211ENST00000543190 ADCY6O43306 1168 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 FGAP02671 866 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 MCCP23508 829 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 FAAP100Q0VG06 881 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 SHHQ15465 462 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 MORC4Q8TE76 937 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 DCAF4Q8WV16 495 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CRBNQ96SW2 442 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 ASB14A6NK59 587 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CTAGE5O15320 804 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 ITGB8P26012 769 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 KCNA10Q16322 511 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 TTC14Q96N46 770 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 SPC25Q9HBM1 224 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 RNF146Q9NTX7 359 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 PNMA2Q9UL42 364 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 TBX21Q9UL17 535 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 Q9Y3F1 56 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 A0A0D9SFI3 127 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 NMT2O60551 498 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 ICAM1P05362 532 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CNTN2Q02246 1040 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 GUCD1Q96NT3 240 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 MAF1Q9H063 256 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 EYSQ5T1H1 3165 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 ASGR1P07306 291 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 KCTD1Q719H9 257 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 FAM227BQ96M60 508 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 INCENPQ9NQS7 918 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 ASTN1O14525 1302 aa22.03■■□□□ 1.12
LTBR-211ENST00000543190 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.03■■□□□ 1.12
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