RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 KLRC3Q07444 240 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TIGD1Q96MW7 591 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 FZD1Q9UP38 647 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ATP1A3P13637 1013 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.08■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PTGS1P23219 599 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ZNF75DP51815 510 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PSME4Q14997 1843 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L15C9J2P7 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L11C9JVI0 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L18D6R9N7 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L22D6RA61 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L19D6RCP7 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USP17L20D6RJB6 530 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 EDIL3O43854 480 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 DGKZQ13574 1117 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 USH1GQ495M9 461 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 LRRC15Q8TF66 581 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 JDP2Q8WYK2 163 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ENTPD3O75355 529 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TDP2O95551 362 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TNNI2P48788 182 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 LRMPQ12912 555 aa16.06■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16.05■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TMEM232C9JQI7 657 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PAGE5Q96GU1 130 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 SLC37A4O43826 429 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TRAPPC10P48553 1259 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.164e-6■■■□□ 17.6
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ACTN1-205ENST00000538545 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 GNA11P29992 359 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 TECP42680 631 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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ACTN1-205ENST00000538545 ZBTB5O15062 677 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 ADCY7P51828 1080 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 FAM151AQ8WW52 585 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 SMARCE1Q969G3 411 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 MED15Q96RN5 788 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PTGER2P43116 358 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 STX17P56962 302 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 CUL4BQ13620 913 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 NEK8Q86SG6 692 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTN1-205ENST00000538545 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.03■□□□□ 0.16
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