RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 CCL15Q16663 113 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 TREML2Q5T2D2 321 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 WWC2Q6AWC2 1192 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 FBXO11Q86XK2 927 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 AMNQ9BXJ7 453 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 BRMS1Q9HCU9 246 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CREBZFQ9NS37 354 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PNMA3Q9UL41 463 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 STXBP3O00186 592 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 BRD1O95696 1058 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CALML3P27482 149 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 APLP1P51693 650 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 NAPAP54920 295 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 NLRP5P59047 1200 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MOGSQ13724 837 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 KRT40Q6A162 431 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 GALNT17Q6IS24 598 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ANKRD23Q86SG2 305 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MB21D1Q8N884 522 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MTMR6Q9Y217 621 aa13.79□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 RLFQ13129 1914 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ESYT2A0FGR8 921 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 VWA5AO00534 786 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 MMP1P03956 469 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ICAM1P05362 532 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 OAZ1P54368 228 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 INHBEP58166 350 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 GUCY1B3Q02153 619 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 CCDC174Q6PII3 467 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 BRI3BPQ8WY22 251 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ATG4CQ96DT6 458 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 GLT8D2Q9H1C3 349 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa13.78□□□□□ -0.2
LMO3-218ENST00000538020 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ABCB11O95342 1321 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 GNA11P29992 359 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 KRT2P35908 639 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 SNAP25P60880 206 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 SREBF2Q12772 1141 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PKP1Q13835 747 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 MCTP1Q6DN14 999 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 LBX2Q6XYB7 198 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 TEX2Q8IWB9 1127 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 BICD2Q8TD16 824 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 COA7Q96BR5 231 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 C6orf50Q9HD87 102 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.77□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 RASSF10A6NK89 507 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 BTBD19C9JJ37 291 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PDHXO00330 501 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ATP2A1O14983 1001 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 F13A1P00488 732 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ADCY7P51828 1080 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 HERVK_113P62684 666 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 USH1GQ495M9 461 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 DAGLBQ8NCG7 672 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 ZNF536O15090 1300 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 SMCO2A6NFE2 343 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 TKFCQ3LXA3 575 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 BRAPQ7Z569 592 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 BLIDQ8IZY5 108 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 CPXCR1Q8N123 301 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 REPS2Q8NFH8 660 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 CUL5Q93034 780 aa13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
LMO3-218ENST00000538020 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms