RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.16□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 LPIN3Q9BQK8 851 aa10.16□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa10.16□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 YDJCA8MPS7 323 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 XYLBO75191 536 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 GPLD1P80108 840 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 ARID5AQ03989 594 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 SLC39A6Q13433 755 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 PERM1Q5SV97 790 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 PI16Q6UXB8 463 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 NACC1Q96RE7 527 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 GGT7Q9UJ14 662 aa10.15□□□□□ -0.78
LMO3-216ENST00000537568 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NPHP1O15259 732 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ALDH1B1P30837 517 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 BMP8BP34820 402 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 MTHFSP49914 203 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 CRY2Q49AN0 593 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NUDCQ9Y266 331 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 KCNMB2Q9Y691 235 aa10.14□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 KIF7Q2M1P5 1343 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 A0A087WZG4 1122 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 H7C1D1 291 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ELNP15502 786 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SELPP16109 830 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ITGB7P26010 798 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 FKBP1BP68106 108 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 PLAURQ03405 335 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 RALBP1Q15311 655 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ERO1AQ96HE7 468 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 C12orf49Q9H741 205 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.13□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 RAC1P63000 192 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 GRIK5Q16478 980 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 CCDC74AQ96AQ1 378 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 GMLQ99445 158 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 GGA3Q9NZ52 723 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 CACNA1GO43497 2377 aa10.12□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NRLP54845 237 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SREBF2Q12772 1141 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ABCC12Q96J65 1359 aa10.11□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 TNFRSF21O75509 655 aa10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NBPF11Q86T75 865 aa10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 VPS37DQ86XT2 251 aa10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 DPF2Q92785 391 aa10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 IRS2Q9Y4H2 1338 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD62A6NC57 917 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 C9orf172C9J069 976 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 MMP20O60882 483 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 CRHR2Q13324 411 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 TNIP1Q15025 636 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 ZNF438Q7Z4V0 828 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 VPS33BQ9H267 617 aa10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
LMO3-216ENST00000537568 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.08□□□□□ -0.8
LMO3-216ENST00000537568 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms