RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CCDC96Q2M329 555 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 KIFC2Q96AC6 838 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 RNF186Q9NXI6 227 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 M0R2N6 131 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 STXBP3O00186 592 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CA12O43570 354 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 EDIL3O43854 480 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 RAD21O60216 631 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TLR2O60603 784 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ICAM1P05362 532 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SLC4A3P48751 1232 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 OAZ1P54368 228 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SREBF2Q12772 1141 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CRHR2Q13324 411 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 JMYQ8N9B5 988 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 IGHA2P01877 340 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 FDX1P10109 184 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SCG2P13521 617 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 OSBPP22059 807 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 MB21D1Q8N884 522 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TBC1D5Q92609 795 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TNFRSF25Q93038 417 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 PORCNQ9H237 461 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 WBP1LQ9NX94 342 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 BARHL2Q9NY43 387 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 DEXIO95424 95 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 STAT3P40763 770 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 GRM1Q13255 1194 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CCDC174Q6PII3 467 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 HSCBQ8IWL3 235 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 RGS22Q8NE09 1264 aa8.6□□□□□ -1.03
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CTSW-202ENST00000524681 AMNQ9BXJ7 453 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CPA4Q9UI42 421 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ASTN1O14525 1302 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ESYT2A0FGR8 921 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 NFIBO00712 420 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 MEIS2O14770 477 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CPLX1O14810 134 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ZBED4O75132 1171 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CDKL5O76039 1030 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TBC1D8O95759 1140 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ALDH1A1P00352 501 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 GJB2P29033 226 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 HSD17B4P51659 736 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ERVK-9P63128 1117 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ERVK-24P63145 666 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 PKP1Q13835 747 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 FBXO11Q86XK2 927 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 HOMER1Q86YM7 354 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSW-202ENST00000524681 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.59□□□□□ -1.03
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