RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SAMM50Q9Y512 469 aa5.98□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.98□□□□□ -1.45
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HDAC2-216ENST00000523628 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.97□□□□□ -1.45
HDAC2-216ENST00000523628 FANCGO15287 622 aa5.97□□□□□ -1.45
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HDAC2-216ENST00000523628 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 FAM221AA4D161 298 aa5.95□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 FYB2Q5VWT5 728 aa5.92□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.92□□□□□ -1.46
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HDAC2-216ENST00000523628 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC6O95255 1503 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 CILPO75339 1184 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 SLITRK5O94991 958 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC2-216ENST00000523628 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.91□□□□□ -1.46
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