RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQH9	124 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GSN	P06396	782 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	MSL3P1	P0C860	447 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PNLIP	P16233	465 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PRKCA	P17252	672 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	VIPR1	P32241	457 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GIPR	P48546	466 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PPP2R5D	Q14738	602 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	FIBCD1	Q8N539	461 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PANK1	Q8TE04	598 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	CRBN	Q96SW2	442 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	PRR13	Q9NZ81	148 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	NUAK1	O60285	661 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	IFNGR1	P15260	489 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	EPHB3	P54753	998 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	MVK	Q03426	396 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SSPN	Q14714	243 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	NUP43	Q8NFH3	380 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1W2PQY0	241 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	VAMP4	O75379	141 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	GJA8	P48165	433 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	PPP2R5E	Q16537	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SHD	Q96IW2	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	FGD4	Q96M96	766 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SEMA7A	O75326	666 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	EPHX1	P07099	455 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CD3E	P07766	207 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CYP4F8	P98187	520 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	NAT16	Q8N8M0	369 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	HAUS7	Q99871	368 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ITGA4	P13612	1032 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CDR1	P51861	262 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SLC7A5	Q01650	507 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	TCEAL1	Q15170	157 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF428	Q96B54	188 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	MPO	P05164	745 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	PI3	P19957	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	TACR1	P25103	407 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDK1-208	ENST00000519760	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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