RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.42□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 GBF1Q92538 1859 aa7.42□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 TRANK1O15050 2925 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ADCY6O43306 1168 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 B4GALT4O60513 344 aa7.41□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 KRT40Q6A162 431 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 CPXCR1Q8N123 301 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 GJD3Q8N144 294 aa7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.41□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 PDE6AP16499 860 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 RFC2P35250 354 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 KCNJ6P48051 423 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 NHLH1Q02575 133 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 GRB10Q13322 594 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.4□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 REPS2Q8NFH8 660 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.4□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CBX1-205ENST00000495350 ZNF536O15090 1300 aa7.4□□□□□ -1.22
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 ASB14A6NK59 587 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 ATP2A1O14983 1001 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 CDK8P49336 464 aa7.39□□□□□ -1.23
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CBX1-205ENST00000495350 CRBNQ96SW2 442 aa7.39□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.39□□□□□ -1.23
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CBX1-205ENST00000495350 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.39□□□□□ -1.23
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CBX1-205ENST00000495350 RIPK3Q9Y572 518 aa7.39□□□□□ -1.23
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CBX1-205ENST00000495350 PSMC6P62333 389 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.38□□□□□ -1.23
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CBX1-205ENST00000495350 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 LCORLQ8N3X6 602 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 SSH3Q8TE77 659 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CBX1-205ENST00000495350 FBXL18Q96ME1 805 aa7.38□□□□□ -1.23
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