RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 BTNL9Q6UXG8 535 aa31.4■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKS1AQ92625 1134 aa31.4■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 AGBL1Q96MI9 1066 aa31.4■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TRERF1Q96PN7 1200 aa31.4■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CDC45O75419 566 aa31.39■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SNAP25P60880 206 aa31.39■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SKAP1Q86WV1 359 aa31.39■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PARP14Q460N5 1801 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 E7EWF7 191 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF792Q3KQV3 632 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF20Q5VTR2 975 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 RASGRP2Q7LDG7 609 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TINF2Q9BSI4 451 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 NRBP1Q9UHY1 535 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 OGDHLQ9ULD0 1010 aa31.38■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ICAM1P05362 532 aa31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ASPRV1Q53RT3 343 aa31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 LAMA4Q16363 1823 aa31.37■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PFASO15067 1338 aa31.36■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 POTEB2H3BUK9 544 aa31.36■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP4R2Q9NY27 417 aa31.36■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.35■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA8HP0CJ92 632 aa31.35■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SNHG28P0DPA3 235 aa31.35■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CYBAP13498 195 aa31.35■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SEPT4O43236 478 aa31.34■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 WTAPQ15007 396 aa31.34■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 C11orf49Q9H6J7 331 aa31.34■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 NR2E3Q9Y5X4 410 aa31.34■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 NSMFQ6X4W1 530 aa31.33■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CYB5R4Q7L1T6 521 aa31.33■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP31.33■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ARRDC4Q8NCT1 418 aa31.33■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF536O15090 1300 aa31.32■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM67Q5HYA8 995 aa31.32■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa31.32■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 LHX8Q68G74 356 aa31.32■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 UBA5Q9GZZ9 404 aa31.32■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CATIPQ7Z7H3 387 aa31.31■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa31.3■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 EVI5O60447 810 aa31.3■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 RARBP10826 455 aa31.3■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa31.3■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TRPV1Q8NER1 839 aa31.3■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa31.29■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ASB14A6NK59 587 aa31.29■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MCM5P33992 734 aa31.29■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 VAT1LQ9HCJ6 419 aa31.29■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 KBTBD13C9JR72 458 aa31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC27A2O14975 620 aa31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 SEC23AQ15436 765 aa31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CREB3L3Q68CJ9 461 aa31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 NFXL1Q6ZNB6 911 aa31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 CHST3Q7LGC8 479 aa31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPDC1A2A3K4 754 aa31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 AKR1A1P14550 325 aa31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ANO1Q5XXA6 986 aa31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 TMTC2Q8N394 836 aa31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM184BQ9ULE4 1060 aa31.27■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR19Q8NEZ3 1342 aa31.26■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa31.26■■■□□ 2.6
CCZ1B-211ENST00000486840 IGHA2P01877 340 aa31.26■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 MUM1L1Q5H9M0 696 aa31.26■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ADGRF4Q8IZF3 695 aa31.26■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa31.26■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 KLRF2D3W0D1 207 aa31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CNTN2Q02246 1040 aa31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 USH1GQ495M9 461 aa31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 STOX1Q6ZVD7 989 aa31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 MTA3Q9BTC8 594 aa31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP39A1Q9NYL5 469 aa31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC69A6NI79 296 aa31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 B4DLN1 442 aa31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 DNM1LO00429 736 aa31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 PRC1O43663 620 aa31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CCZ1B-211ENST00000486840 TRAF1Q13077 416 aa31.24■■■□□ 2.59
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