RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 ERVK-21P61565 698 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ACVR2BQ13705 512 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CABYRO75952 493 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CIAO1O76071 339 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CYP2C9P11712 490 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 PLCG2P16885 1265 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SCN5AQ14524 2016 aa14.64□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 TIMM10P62072 90 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 PSMC6P62333 389 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 NKX3-2P78367 333 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SEPT2Q15019 361 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ASTN1O14525 1302 aa14.63□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 LINC01553A4QN01 128 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 KDM4AO75164 1064 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 BAG3O95817 575 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 KCNJ6P48051 423 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 COL19A1Q14993 1142 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CCDC27Q2M243 656 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SPATA5Q8NB90 893 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CABP5Q9NP86 173 aa14.62□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 AVPR2P30518 371 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 RFC2P35250 354 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 NBL1P41271 181 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 PPP4CP60510 307 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ZXDAP98168 799 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CLUL1Q15846 466 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ADSSL1Q8N142 457 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 RMDN1Q96DB5 314 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 FBXO3Q9UK99 471 aa14.61□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 BAIAP3O94812 1187 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SHMT1P34896 483 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 XAGE2Q96GT9 111 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 CLDND1Q9NY35 253 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 PTPRSQ13332 1948 aa14.6□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 FOCADQ5VW36 1801 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 TET1Q8NFU7 2136 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 PTGS1P23219 599 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 STAT3P40763 770 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 DEFB103AP81534 67 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 WWC1Q8IX03 1113 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 BANK1Q8NDB2 785 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 EHD4Q9H223 541 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 MYO7AQ13402 2215 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 TNKSO95271 1327 aa14.59□□□□□ -0.07
USP11-208ENST00000480104 SIP14410 1827 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 A0A1B0GUL7 405 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 STXBP3O00186 592 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 LTBRP36941 435 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 PTPROQ16827 1216 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 TLK2Q86UE8 772 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 DDX11Q96FC9 970 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 FGD4Q96M96 766 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 RAD9AQ99638 391 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 USP44Q9H0E7 712 aa14.58□□□□□ -0.08
USP11-208ENST00000480104 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms