RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 ARRDC4Q8NCT1 418 aa27.56■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.56■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.56■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 KDM4AO75164 1064 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF543Q08ER8 600 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD35Q8N283 1001 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 KRT23Q9C075 422 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 SGSM2O43147 1006 aa27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 ICAM1P05362 532 aa27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC96Q2M329 555 aa27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 SYDE2Q5VT97 1194 aa27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 RNF146Q9NTX7 359 aa27.54■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 B4E1Z4 1266 aa27.53■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 PNMA2Q9UL42 364 aa27.53■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 TRERF1Q96PN7 1200 aa27.52■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.52■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.51■■■□□ 2
C9orf3-215ENST00000478473 AKR1A1P14550 325 aa27.51■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SLC4A3P48751 1232 aa27.51■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.51■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.51■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SLC16A2P36021 539 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 PTH1RQ03431 593 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC26Q2I0M4 334 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 PNMA1Q8ND90 353 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 HOMER2Q9NSB8 354 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 MTMR7Q9Y216 660 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 DNAH12Q6ZR08 3092 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CYP21A2P08686 494 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ALAS1P13196 640 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC41Q15345 812 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC174Q6PII3 467 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 KATNBL1Q9H079 304 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 POTEB2H3BUK9 544 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 RARBP10826 455 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SNAP25P60880 206 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 MUM1L1Q5H9M0 696 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ANO1Q5XXA6 986 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CHRDL2Q6WN34 429 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 MAP4K1Q92918 833 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CYP39A1Q9NYL5 469 aa27.48■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 TNKSO95271 1327 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SOWAHBA6NEL2 793 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ACVR2BQ13705 512 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SNX17Q15036 470 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 SEC23AQ15436 765 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ARMCX2Q7L311 632 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 C7orf61Q8IZ16 206 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 GDF15Q99988 308 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 FAM184BQ9ULE4 1060 aa27.47■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 A0A1W2PPC1 479 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 KBTBD13C9JR72 458 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 ADAMTS4O75173 837 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 CNTN2Q02246 1040 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 C1orf53Q5VUE5 145 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 MORC4Q8TE76 937 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 MAF1Q9H063 256 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 KAT14Q9H8E8 782 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 PHF24Q9UPV7 400 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa27.46■■□□□ 1.99
C9orf3-215ENST00000478473 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa27.45■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 BMP8BP34820 402 aa27.45■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.45■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa27.45■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 ASTN1O14525 1302 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 ASB14A6NK59 587 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 NKX3-2P78367 333 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 RNF180Q86T96 592 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 CLEC4DQ8WXI8 215 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.44■■□□□ 1.98
C9orf3-215ENST00000478473 KLHDC9Q8NEP7 349 aa27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms