RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475321.5

RBBP4-210, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-210	ENST00000475321	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	KLF4	O43474	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	NAT2	P11245	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	BMP7	P18075	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	RAB33A	Q14088	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	SNX17	Q15036	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	TRIM13	O60858	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	DDAH1	O94760	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	SYN1	P17600	705 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	CHRNE	Q04844	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	HRK	O00198	91 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	RFXAP	O00287	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	NFIX	Q14938	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-210	ENST00000475321		A0A087WZG4	1122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321		C9IYK1	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	LRRN2	O75325	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	LTK	P29376	864 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	TEK	Q02763	1124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	SSPN	Q14714	243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	DDR2	Q16832	855 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	MKL1	Q969V6	931 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	APBA2	Q99767	749 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	EPN3	Q9H201	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	PPM1B	O75688	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	ITGA4	P13612	1032 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	CD247	P20963	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	DUSP4	Q13115	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	HAUS7	Q99871	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-210	ENST00000475321	WHRN	Q9P202	907 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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