RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ACAD9Q9H845 621 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 RIPK3Q9Y572 518 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 COBLO75128 1261 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 SGPL1O95470 568 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.13■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CCL14Q16627 93 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 DDX11Q96FC9 970 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 MAML3Q96JK9 1138 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K14Q99558 947 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 PFASO15067 1338 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 MSCO60682 206 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 SLC16A2P36021 539 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 LIFRP42702 1097 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 RNF146Q9NTX7 359 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ANTXR2P58335 489 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CCDC174Q6PII3 467 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 KCNB2Q92953 911 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 PRC1O43663 620 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 ALAS1P13196 640 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TRIM32Q13049 653 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 DEFB118Q96PH6 123 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 NEK1Q96PY6 1258 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 DDAH1O94760 285 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A3P48751 1232 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TROAPQ12815 778 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TRAF1Q13077 416 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 GRM4Q14833 912 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 TINF2Q9BSI4 451 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 BRCA2P51587 3418 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 PGK2P07205 417 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CALM1P0DP23 149 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CALM2P0DP24 149 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CALM3P0DP25 149 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CYBAP13498 195 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 HSPA4P34932 840 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SHISA4Q96DD7 197 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 LY9Q9HBG7 655 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 KLRF2D3W0D1 207 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 KIF5BP33176 963 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CYP2C19P33261 490 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CHST3Q7LGC8 479 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 POTEB2H3BUK9 544 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SMARCA1P28370 1054 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 GNAQP50148 359 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 RGS22Q8NE09 1264 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 MTMR8Q96EF0 704 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 ABCB11O95342 1321 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 CCDC69A6NI79 296 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SEPT4O43236 478 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 SNAP25P60880 206 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-203ENST00000474160 RASEFQ8IZ41 740 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms