RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PIM2Q9P1W9 311 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 LAMB1P07942 1786 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SLC26A4O43511 780 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TFAP4Q01664 338 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZNF174Q15697 407 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NPY5RQ15761 445 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 E2F4Q16254 413 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SYT10Q6XYQ8 523 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PDILTQ8N807 584 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TTLL6Q8N841 843 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TC2NQ8N9U0 490 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RETREG2Q8NC44 543 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PNMA1Q8ND90 353 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SYT17Q9BSW7 474 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 C6orf50Q9HD87 102 aa9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WWV3 80 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQC6 194 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ESYT2A0FGR8 921 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 BICDL2A1A5D9 508 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TSPY3P0CV98 308 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TSPY8P0CW00 308 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ATP2B1P20020 1258 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PBX1P40424 430 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 UBA7P41226 1012 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K9P80192 1104 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PAK1Q13153 545 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SPECC1Q5M775 1068 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TMEM139Q8IV31 216 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 KRT222Q8N1A0 295 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZNF384Q8TF68 577 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DPF2Q92785 391 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 EPSTI1Q96J88 318 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NUP58Q9BVL2 599 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 THAP9Q9H5L6 903 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 BARHL2Q9NY43 387 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.6□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 LTBP1Q14766 1721 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SLX4Q8IY92 1834 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PSMA7O14818 248 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 KIF5CO60282 957 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 KIF20AO95235 890 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 IL1R1P14778 569 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 STAT6P42226 847 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 AFMP43652 599 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MCTP2Q6DN12 878 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CEP112Q8N8E3 955 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RAB34Q9BZG1 259 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.59□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 COL4A1P02462 1669 aa9.58□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TAF1P21675 1872 aa9.58□□□□□ -0.88
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