RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.93■■□□□ 1.9
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USP4-208ENST00000464168 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.92■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 TSPY3P0CV98 308 aa26.92■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 TSPY8P0CW00 308 aa26.92■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 TFAP4Q01664 338 aa26.92■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 PDE4BQ07343 736 aa26.92■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.92■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 ELP1O95163 1332 aa26.91■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 MYH4Q9Y623 1939 aa26.91■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 TMEM232C9JQI7 657 aa26.91■■□□□ 1.9
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USP4-208ENST00000464168 CDK7P50613 346 aa26.91■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 ARMCX2Q7L311 632 aa26.91■■□□□ 1.9
USP4-208ENST00000464168 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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USP4-208ENST00000464168 TBX21Q9UL17 535 aa26.91■■□□□ 1.9
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USP4-208ENST00000464168 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.9■■□□□ 1.9
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USP4-208ENST00000464168 STAT2P52630 851 aa26.88■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 GNASQ5JWF2 1037 aa26.88■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 FAM133AQ8N9E0 248 aa26.88■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.88■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.88■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 GMCL1Q96IK5 515 aa26.88■■□□□ 1.89
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USP4-208ENST00000464168 ZNF536O15090 1300 aa26.88■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 MCCP23508 829 aa26.87■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 FAM160B2Q86V87 743 aa26.87■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.87■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.87■■□□□ 1.89
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USP4-208ENST00000464168 SOWAHBA6NEL2 793 aa26.85■■□□□ 1.89
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USP4-208ENST00000464168 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.85■■□□□ 1.89
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USP4-208ENST00000464168 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 MX1P20591 662 aa26.83■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 TNFAIP2Q03169 654 aa26.83■■□□□ 1.89
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USP4-208ENST00000464168 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.83■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.83■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 KCTD1Q719H9 257 aa26.83■■□□□ 1.89
USP4-208ENST00000464168 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.83■■□□□ 1.89
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USP4-208ENST00000464168 BEX3Q00994 111 aa26.82■■□□□ 1.88
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USP4-208ENST00000464168 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.82■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 FAM126BQ8IXS8 530 aa26.82■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 ASB14A6NK59 587 aa26.81■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 TSPY2A6NKD2 308 aa26.81■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 ALAS1P13196 640 aa26.81■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 TMEM240Q5SV17 173 aa26.81■■□□□ 1.88
USP4-208ENST00000464168 CCDC174Q6PII3 467 aa26.81■■□□□ 1.88
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