RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448514.1

GGTLC2-202, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-202ENST00000448514 ITGB8P26012 769 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 NKX3-2P78367 333 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 KCNA10Q16322 511 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 SPC25Q9HBM1 224 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.19■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 DCDC2CA8MYV0 355 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 RAG1P15918 1043 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 SLC1A4P43007 532 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 SLC4A3P48751 1232 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 GJA9P57773 515 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 FAAP100Q0VG06 881 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TKFCQ3LXA3 575 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TICAM2Q86XR7 235 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ACAD9Q9H845 621 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TMEM39AQ9NV64 488 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.18■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 FOXP2O15409 715 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 NOVP48745 357 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CDK7P50613 346 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CCDC144BQ3MJ40 725 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ARMCX2Q7L311 632 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 KATNBL1Q9H079 304 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 SEMA6BQ9H3T3 888 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ZNF536O15090 1300 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 EYSQ5T1H1 3165 aa18.17■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.16■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 FPGSQ05932 587 aa18.16■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.16■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.16■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 EVI5LQ96CN4 794 aa18.16■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 STX8Q9UNK0 236 aa18.16■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 MYH4Q9Y623 1939 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 MYADML2A6NDP7 307 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TSPY2A6NKD2 308 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ADCY6O43306 1168 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TIMP1P01033 207 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 FGRP09769 529 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 MCCP23508 829 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 EPHB4P54760 987 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CNTN2Q02246 1040 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ALX1Q15699 326 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 FAM161BQ96MY7 647 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 RNF146Q9NTX7 359 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 TBX21Q9UL17 535 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 CDH23Q9H251 3354 aa18.15■□□□□ 0.5
GGTLC2-202ENST00000448514 ASB14A6NK59 587 aa18.14■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 ORC4O43929 436 aa18.14■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 ASGR1P07306 291 aa18.14■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 GNASQ5JWF2 1037 aa18.14■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.14■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 ARVCFO00192 962 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 MFSD5Q6N075 450 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.13■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 CTAGE5O15320 804 aa18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 TNFAIP2Q03169 654 aa18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 KCTD1Q719H9 257 aa18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 DCAF4Q8WV16 495 aa18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 NMT2O60551 498 aa18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 CABYRO75952 493 aa18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 ALAS1P13196 640 aa18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 PDE1AP54750 535 aa18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 VPS53Q5VIR6 699 aa18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 CCDC174Q6PII3 467 aa18.11■□□□□ 0.49
GGTLC2-202ENST00000448514 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms