RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	ESR2	Q92731	530 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	NFIB	O00712	420 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	SEC23A	Q15436	765 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	PNMA1	Q8ND90	353 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	MROH8	Q9H579	483 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HDLBP-216	ENST00000428482	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	MYADML2	A6NDP7	307 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482		E7EWF7	191 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC25A27	O95847	323 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	FCER1A	P12319	257 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ALAS1	P13196	640 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CNTN2	Q02246	1040 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM160B2	Q86V87	743 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	MYL10	Q9BUA6	226 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC27A2	O14975	620 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ATP2A1	O14983	1001 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ZBED4	O75132	1171 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CNGA1	P29973	690 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ACAD9	Q9H845	621 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	RXRA	P19793	462 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	KCTD2	Q14681	263 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	USH1G	Q495M9	461 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	MAP4K1	Q92918	833 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	KATNBL1	Q9H079	304 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	KAT14	Q9H8E8	782 aa		12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482		H0YGN5	161 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CDC45	O75419	566 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ICAM1	P05362	532 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	OAZ1	P54368	228 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	NSMF	Q6X4W1	530 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	PLA2G6	O60733	806 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	COL6A1	P12109	1028 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	COPB2	P35606	906 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HDLBP-216	ENST00000428482	KRT23	Q9C075	422 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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