RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 MCCP23508 829 aa24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 INCENPQ9NQS7 918 aa24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
LIMS1-208ENST00000428064 NMT2O60551 498 aa24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 FGAP02671 866 aa24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 SLC4A3P48751 1232 aa24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ACVR2BQ13705 512 aa24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 LNPKQ9C0E8 428 aa24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB123Q8N688 67 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF4Q8WV16 495 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 RNF146Q9NTX7 359 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.81■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 MCM3APO60318 1980 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ACLYP53396 1101 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TLE2Q04725 743 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD1Q719H9 257 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ARMCX2Q7L311 632 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 KATNBL1Q9H079 304 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.8■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CLTBP09497 229 aa24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TOX2Q96NM4 488 aa24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 LAMA4Q16363 1823 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 POTEB2H3BUK9 544 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 NKX3-2P78367 333 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.78■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0355O15063 1070 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY6O43306 1168 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 NT5C2P49902 561 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 GJA9P57773 515 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 BADQ92934 168 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 SPC25Q9HBM1 224 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.77■■□□□ 1.56
LIMS1-208ENST00000428064 ASB14A6NK59 587 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 ICAM1P05362 532 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 ALAS1P13196 640 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CNTN2Q02246 1040 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 NUCB1Q02818 461 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 KCNA10Q16322 511 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 Q7L0L9 218 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM22Q9NS69 142 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 ELP1O95163 1332 aa24.76■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 LCTP09848 1927 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 MYADML2A6NDP7 307 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 RILPL2Q969X0 211 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 TTC14Q96N46 770 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.75■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 SDSP20132 328 aa24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC96Q2M329 555 aa24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC174Q6PII3 467 aa24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-208ENST00000428064 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.74■■□□□ 1.55
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