RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.65	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BACH1	O14867	736 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP27B1	O15528	508 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCNN1B	P51168	640 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIPK1	Q13546	671 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATL2	Q8NHH9	583 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K13	O43283	966 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC51	Q96ER9	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP21A2	P08686	494 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC25A	P30304	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBED6	P86452	979 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHP1	Q99653	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYL1	P05976	194 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GHR	P10912	638 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C8orf37	Q96NL8	207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STXBP3	O00186	592 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OAT	P04181	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPARA	Q07869	468 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CUL3	Q13618	768 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AACS	Q86V21	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	P3H4	Q92791	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.62	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C5	P01031	1676 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDUFA10	O95299	355 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQCE	Q6IPM2	695 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAF1	Q9H063	256 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C2CD2	Q9Y426	696 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.61	□□□□□ -0.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM153B	P0C7A2	387 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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