RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 STAT6P42226 847 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF445P59923 1031 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GNG11P61952 73 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MECOMQ03112 1051 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RASGRF1Q13972 1273 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HDXQ7Z353 690 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FSIP1Q8NA03 581 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MORC4Q8TE76 937 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FERMT2Q96AC1 680 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 EXOC1Q9NV70 894 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ADCY9O60503 1353 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC27A2O14975 620 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR2MP0CAP2 368 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HUNKP57058 714 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA1Q92805 767 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.9□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF1AQ12756 1690 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TNS2Q63HR2 1409 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CTAGE9A4FU28 777 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L5A8MUK1 530 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT13P13646 458 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MCM7P33993 719 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DDIT3P35638 169 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CACNB3P54284 484 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 COG7P83436 770 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.637e-7■■■□□ 17.5
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP58Q5T655 872 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HACE1Q8IYU2 909 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TMX3Q96JJ7 454 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 STK24Q9Y6E0 443 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 KLRF2D3W0D1 207 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HIP1RO75146 1068 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 BMP3P12645 472 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RASSF2P50749 326 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBB2AQ13885 445 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 OTUD5Q96G74 571 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RMND1Q9NWS8 449 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 VPS18Q9P253 973 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PXDNQ92626 1479 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 BICDL2A1A5D9 508 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SH3BP5O60239 455 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RFX1P22670 979 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS6KB1P23443 525 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDX5P30044 214 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PSMC4P43686 418 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 VAV2P52735 878 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 BLVRAP53004 296 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SMTNP53814 917 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF5AQ12840 1032 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TRPC3Q13507 836 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM160B2Q86V87 743 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 AMNQ9BXJ7 453 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXC10Q9NYD6 342 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 TNKSO95271 1327 aa4.89□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SNAP23O00161 211 aa4.88□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 NTSR2O95665 410 aa4.88□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FGAP02671 866 aa4.88□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ADD2P35612 726 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms