RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 FAM205CA6NFA0 338 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 C19orf81C9J6K1 198 aa23.5■■□□□ 1.35
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ATG4B-204ENST00000402096 VCAM1P19320 739 aa23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 ATP2B1P20020 1258 aa23.5■■□□□ 1.35
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ATG4B-204ENST00000402096 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.49■■□□□ 1.35
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ATG4B-204ENST00000402096 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-204ENST00000402096 UBE2HP62256 183 aa23.48■■□□□ 1.35
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ATG4B-204ENST00000402096 C12orf42Q96LP6 360 aa23.45■■□□□ 1.34
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ATG4B-204ENST00000402096 M0R2N6 131 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 SPTLC2O15270 562 aa23.44■■□□□ 1.34
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ATG4B-204ENST00000402096 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.44■■□□□ 1.34
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ATG4B-204ENST00000402096 TMEM260Q9NX78 707 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 SLC39A14Q15043 492 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 UBE2SQ16763 222 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 TTC38Q5R3I4 469 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 PGBD1Q96JS3 809 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.43■■□□□ 1.34
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ATG4B-204ENST00000402096 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 TRAPPC10P48553 1259 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 PTPAQ15257 358 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 INF2Q27J81 1249 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 JMYQ8N9B5 988 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 OPTNQ96CV9 577 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 IRF6O14896 467 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF174Q15697 407 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.41■■□□□ 1.34
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