RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 ADAMTS3O15072 1205 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CFBP00751 764 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PRR29P0C7W0 189 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 UBXN2AP68543 259 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 RESP18Q5W5W9 173 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TMEM179Q6ZVK1 233 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DNAJC18Q9H819 358 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L15C9J2P7 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L11C9JVI0 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L18D6R9N7 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L22D6RA61 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L19D6RCP7 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L20D6RJB6 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FGRP09769 529 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ADCY7P51828 1080 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L24Q0WX57 530 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.13■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FANCLQ9NW38 375 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 WNT7AO00755 349 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PTPREP23469 700 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DLK2Q6UY11 383 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 EEF2KMTQ96G04 330 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.12■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 NDUFB10O96000 172 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TBCKQ8TEA7 893 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FANCCQ00597 558 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 MYL5Q02045 173 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TNFAIP1Q13829 316 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CHD4Q14839 1912 aa15.11■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 BMP3P12645 472 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 RCAN1P53805 252 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ZNF543Q08ER8 600 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FUT2Q10981 343 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PLS1Q14651 629 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GJA10Q969M2 543 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 HACL1Q9UJ83 578 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 PP2D1A8MPX8 630 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FAM151AQ8WW52 585 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TMX1Q9H3N1 280 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 BARHL2Q9NY43 387 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.1■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GABPAQ06546 454 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 ENTPD3O75355 529 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 STAT6P42226 847 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TECP42680 631 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 DGKZQ13574 1117 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 IDI2Q9BXS1 227 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 GGA3Q9NZ52 723 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 EPS15P42566 896 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.09■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.08■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 TNNT1P13805 278 aa15.08■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.08■□□□□ 0.01
HCN3-201ENST00000368358 SHISA4Q96DD7 197 aa15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms