RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349157.10

PUF60-202, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUF60, Length 1,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-202ENST00000349157 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.14■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 PDILTQ8N807 584 aa22.13■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 E2F4Q16254 413 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-202ENST00000349157 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 OR52Z1P0C646 297 aa22.12■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.12■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 A0A087X0B3 334 aa22.08■■□□□ 1.13
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PUF60-202ENST00000349157 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
PUF60-202ENST00000349157 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-202ENST00000349157 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PUF60-202ENST00000349157 COA7Q96BR5 231 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-202ENST00000349157 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-202ENST00000349157 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PUF60-202ENST00000349157 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.05■■□□□ 1.12
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