RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 NEK8Q86SG6 692 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 TMX2Q9Y320 296 aa18.49■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 BMP3P12645 472 aa18.48■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 INF2Q27J81 1249 aa18.48■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa18.47■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.47■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 SERTAD1Q9UHV2 236 aa18.47■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 BECN2A8MW95 431 aa18.46■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 SLC16A2P36021 539 aa18.46■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.46■□□□□ 0.55
HPS1-202ENST00000338546 SARM1Q6SZW1 724 aa18.46■□□□□ 0.55
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HPS1-202ENST00000338546 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 SMARCE1Q969G3 411 aa18.43■□□□□ 0.54
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HPS1-202ENST00000338546 DACH1Q9UI36 760 aa18.43■□□□□ 0.54
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HPS1-202ENST00000338546 RAD21O60216 631 aa18.42■□□□□ 0.54
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HPS1-202ENST00000338546 PRELPP51888 382 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 TPM4P67936 248 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 SEMA3FQ13275 785 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 AP3B2Q13367 1082 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 E2F4Q16254 413 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 VCPKMTQ9H867 229 aa18.42■□□□□ 0.54
HPS1-202ENST00000338546 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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