RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 TROAPQ12815 778 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 GRM4Q14833 912 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 CCDC174Q6PII3 467 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 USP6NLQ92738 828 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 MROH8Q9H579 483 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.58■■□□□ 1.53
COX5B-201ENST00000258424 SLC25A27O95847 323 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 LIFRP42702 1097 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 GRB14Q14449 540 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 SHISA4Q96DD7 197 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 MYL10Q9BUA6 226 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.57■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 ELNP15502 786 aa24.56■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A3P48751 1232 aa24.56■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.56■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.56■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 BRCA2P51587 3418 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 CYP2B6P20813 491 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 MAP2K5Q13163 448 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.55■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 CCDC69A6NI79 296 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 KLRF2D3W0D1 207 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 DDAH1O94760 285 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 INHAP05111 366 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 RPS6KB1P23443 525 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 ADORA2AP29274 412 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 COPB2P35606 906 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 TMTC2Q8N394 836 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.54■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 RXRAP19793 462 aa24.53■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 RGS2P41220 211 aa24.53■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 APBA2Q99767 749 aa24.53■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.53■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 STRNO43815 780 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 SGPL1O95470 568 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 ICAM1P05362 532 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 FCER1AP12319 257 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 CCL14Q16627 93 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 TRIB2Q92519 343 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 DPF3Q92784 378 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 MMP19Q99542 508 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.52■■□□□ 1.52
COX5B-201ENST00000258424 LCTP09848 1927 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 COBLO75128 1261 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 ALAS1P13196 640 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 PSMA5P28066 241 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 APOA5Q6Q788 366 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 Q6ZUG5 572 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 RNF146Q9NTX7 359 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.51■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 HOXC6P09630 235 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 CAPN2P17655 700 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 CHST13Q8NET6 341 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K14Q99558 947 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.5■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 H0YGN5 161 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 CYTH3O43739 400 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 PGK2P07205 417 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 TRIM32Q13049 653 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 KCTD2Q14681 263 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 RUFY3Q7L099 469 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 MICU3Q86XE3 530 aa24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
COX5B-201ENST00000258424 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.49■■□□□ 1.51
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