RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 STIM2Q9P246 746 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 TNNI2P48788 182 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 TLDC2A0PJX2 215 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 CUL1Q13616 776 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 PBKQ96KB5 322 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.96□□□□□ -0.81
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC169A6NNP5 214 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ENC1O14682 589 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CALCRLQ16602 461 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 STK17AQ9UEE5 414 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 AMFRQ9UKV5 643 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 B4DLN1 442 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 FAM13AO94988 1023 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NNTQ13423 1086 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 DRP2Q13474 957 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NLRP3Q96P20 1036 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.96□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ANKRD62A6NC57 917 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 TBC1D8O95759 1140 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NR1D1P20393 614 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ADCY7P51828 1080 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 SLMAPQ14BN4 828 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PPP1R7Q15435 360 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 FBXL16Q8N461 479 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 TC2NQ8N9U0 490 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 VEZTQ9HBM0 779 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ERBB3P21860 1342 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ATP1A2P50993 1020 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 GUCY2DQ02846 1103 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NR1I3Q14994 352 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 SEPT2Q15019 361 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CHUKO15111 745 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 TNFAIP3P21580 790 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 GUCY2FP51841 1108 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 DPF2Q92785 391 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 KIF28PB7ZC32 967 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 C2orf54Q08AI8 447 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 DAAM2Q86T65 1068 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 ST7Q9NRC1 585 aa9.95□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC38Q502W7 563 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC174Q6PII3 467 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NEK8Q86SG6 692 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC197Q8NCU1 140 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 TXKP42681 527 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PSMD2Q13200 908 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NR5A1Q13285 461 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 BIRC3Q13489 604 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 AIFM3Q96NN9 605 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 PSMB7Q99436 277 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 LY9Q9HBG7 655 aa9.94□□□□□ -0.82
TTLL4-201ENST00000258398 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms